ਡਿਜ਼ਾਈਨ ਸਕੀਮ ਅਤੇ ਪੌਲੀਪੇਪਟਾਈਡ ਪੇਪਟਾਇਡ ਚੇਨ ਦਾ ਹੱਲ

I. ਸੰਖੇਪ
ਪੇਪਟਾਇਡਸ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਮੈਕ੍ਰੋਮੋਲੀਕਿਊਲ ਹੁੰਦੇ ਹਨ ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਕ੍ਰਮ ਉਹਨਾਂ ਦੀਆਂ ਰਸਾਇਣਕ ਅਤੇ ਭੌਤਿਕ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਵਿੱਚ ਅਸਾਧਾਰਨ ਹੁੰਦੇ ਹਨ।ਕੁਝ ਪੇਪਟਾਇਡਾਂ ਦਾ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨਾ ਔਖਾ ਹੁੰਦਾ ਹੈ, ਜਦੋਂ ਕਿ ਦੂਸਰੇ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ ਮੁਕਾਬਲਤਨ ਆਸਾਨ ਹੁੰਦੇ ਹਨ ਪਰ ਸ਼ੁੱਧ ਕਰਨਾ ਮੁਸ਼ਕਲ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।ਵਿਹਾਰਕ ਸਮੱਸਿਆ ਇਹ ਹੈ ਕਿ ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਪੇਪਟਾਇਡ ਜਲਮਈ ਘੋਲ ਵਿੱਚ ਥੋੜ੍ਹਾ ਘੁਲਣਸ਼ੀਲ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਇਸ ਲਈ ਸਾਡੇ ਸ਼ੁੱਧੀਕਰਨ ਵਿੱਚ, ਹਾਈਡ੍ਰੋਫੋਬਿਕ ਪੇਪਟਾਇਡ ਦੇ ਅਨੁਸਾਰੀ ਹਿੱਸੇ ਨੂੰ ਗੈਰ-ਜਲਦਾਰ ਘੋਲਨ ਵਿੱਚ ਘੁਲਿਆ ਜਾਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ, ਇਸਲਈ, ਇਹ ਘੋਲਨ ਜਾਂ ਬਫਰਾਂ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਨਾਲ ਗੰਭੀਰ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਅਸੰਗਤ ਹੋਣ ਦੀ ਸੰਭਾਵਨਾ ਹੈ। ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਯੋਗਾਤਮਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ, ਤਾਂ ਜੋ ਟੈਕਨੀਸ਼ੀਅਨਾਂ ਨੂੰ ਆਪਣੇ ਉਦੇਸ਼ਾਂ ਲਈ ਪੇਪਟਾਇਡ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਨ ਤੋਂ ਸਖਤੀ ਨਾਲ ਮਨਾਹੀ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ, ਤਾਂ ਜੋ ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਲਈ ਪੇਪਟਾਇਡ ਦੇ ਡਿਜ਼ਾਈਨ ਦੇ ਕਈ ਪਹਿਲੂ ਹੇਠਾਂ ਦਿੱਤੇ ਗਏ ਹਨ।

ਡਿਜ਼ਾਈਨ ਸਕੀਮ ਅਤੇ ਪੌਲੀਪੇਪਟਾਈਡ ਪੇਪਟਾਇਡ ਚੇਨ ਦਾ ਹੱਲ
ਦੂਜਾ, ਸਿੰਥੈਟਿਕ ਮੁਸ਼ਕਲ ਪੇਪਟਾਇਡਸ ਦੀ ਸਹੀ ਚੋਣ
1. ਡਾਊਨ-ਨਿਯੰਤ੍ਰਿਤ ਕ੍ਰਮਾਂ ਦੀ ਕੁੱਲ ਲੰਬਾਈ
15 ਤੋਂ ਘੱਟ ਰਹਿੰਦ-ਖੂੰਹਦ ਵਾਲੇ ਪੇਪਟਾਇਡਾਂ ਨੂੰ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਨਾ ਆਸਾਨ ਹੁੰਦਾ ਹੈ ਕਿਉਂਕਿ ਪੇਪਟਾਇਡ ਦਾ ਆਕਾਰ ਵਧਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਕੱਚੇ ਉਤਪਾਦ ਦੀ ਸ਼ੁੱਧਤਾ ਘੱਟ ਜਾਂਦੀ ਹੈ।ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਪੇਪਟਾਇਡ ਚੇਨ ਦੀ ਕੁੱਲ ਲੰਬਾਈ 20 ਰਹਿੰਦ-ਖੂੰਹਦ ਤੋਂ ਵੱਧ ਜਾਂਦੀ ਹੈ, ਉਤਪਾਦ ਦੀ ਸਹੀ ਮਾਤਰਾ ਇੱਕ ਮੁੱਖ ਚਿੰਤਾ ਹੈ।ਬਹੁਤ ਸਾਰੇ ਪ੍ਰਯੋਗਾਂ ਵਿੱਚ, ਰਹਿੰਦ-ਖੂੰਹਦ ਨੂੰ 20 ਤੋਂ ਹੇਠਾਂ ਘਟਾ ਕੇ ਅਚਾਨਕ ਪ੍ਰਭਾਵ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਨਾ ਆਸਾਨ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।
2. ਹਾਈਡ੍ਰੋਫੋਬਿਕ ਰਹਿੰਦ-ਖੂੰਹਦ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਘਟਾਓ
ਹਾਈਡ੍ਰੋਫੋਬਿਕ ਰਹਿੰਦ-ਖੂੰਹਦ ਦੀ ਇੱਕ ਵੱਡੀ ਪ੍ਰਮੁੱਖਤਾ ਵਾਲੇ ਪੇਪਟਾਇਡਸ, ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸੀ-ਟਰਮਿਨਸ ਤੋਂ 7-12 ਖੂੰਹਦ ਖੇਤਰ ਵਿੱਚ, ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਿੰਥੈਟਿਕ ਮੁਸ਼ਕਲਾਂ ਦਾ ਕਾਰਨ ਬਣਦੇ ਹਨ।ਇਸ ਨੂੰ ਇੱਕ ਅਢੁਕਵੇਂ ਸੁਮੇਲ ਵਜੋਂ ਦੇਖਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ ਕਿਉਂਕਿ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਬੀ-ਫੋਲਡ ਸ਼ੀਟ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ।"ਅਜਿਹੇ ਮਾਮਲਿਆਂ ਵਿੱਚ, ਦੋ ਤੋਂ ਵੱਧ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਅਤੇ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਰਹਿੰਦ-ਖੂੰਹਦ ਨੂੰ ਬਦਲਣਾ, ਜਾਂ ਪੇਪਟਾਇਡ ਰਚਨਾ ਨੂੰ ਅਨਲੌਕ ਕਰਨ ਲਈ ਗਲਾਈ ਜਾਂ ਪ੍ਰੋ ਨੂੰ ਪੇਪਟਾਇਡ ਵਿੱਚ ਪਾਉਣਾ ਲਾਭਦਾਇਕ ਹੋ ਸਕਦਾ ਹੈ।"
3. "ਮੁਸ਼ਕਲ" ਰਹਿੰਦ-ਖੂੰਹਦ ਨੂੰ ਘਟਾਉਣਾ
"ਇੱਥੇ ਬਹੁਤ ਸਾਰੇ Cys, Met, Arg, ਅਤੇ Try ਰਹਿੰਦ-ਖੂੰਹਦ ਹਨ ਜੋ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਆਸਾਨੀ ਨਾਲ ਸਿੰਥੇਸਾਈਜ਼ ਨਹੀਂ ਕੀਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ।"Ser ਨੂੰ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ Cys ਦੇ ਨਾਨ-ਆਕਸੀਡੇਟਿਵ ਵਿਕਲਪ ਵਜੋਂ ਵਰਤਿਆ ਜਾਵੇਗਾ।
ਡਿਜ਼ਾਈਨ ਸਕੀਮ ਅਤੇ ਪੌਲੀਪੇਪਟਾਈਡ ਪੇਪਟਾਇਡ ਚੇਨ ਦਾ ਹੱਲ

ਤੀਜਾ, ਪਾਣੀ ਵਿੱਚ ਘੁਲਣਸ਼ੀਲ ਦੀ ਸਹੀ ਚੋਣ ਵਿੱਚ ਸੁਧਾਰ ਕਰੋ
1. N ਜਾਂ C ਟਰਮੀਨਸ ਨੂੰ ਐਡਜਸਟ ਕਰੋ
ਐਸੀਡਿਕ ਪੇਪਟਾਇਡਸ (ਜੋ ਕਿ, pH 7 'ਤੇ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਚਾਰਜ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ), ਐਸੀਟਿਲੇਸ਼ਨ (ਐਨ-ਟਰਮਿਨਸ ਐਸੀਟਿਲੇਸ਼ਨ, ਸੀ ਟਰਮਿਨਸ ਹਮੇਸ਼ਾ ਇੱਕ ਮੁਫਤ ਕਾਰਬੋਕਸਾਈਲ ਸਮੂਹ ਨੂੰ ਕਾਇਮ ਰੱਖਦਾ ਹੈ) ਦੇ ਸਬੰਧ ਵਿੱਚ ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਚਾਰਜ ਨੂੰ ਵਧਾਉਣ ਦੀ ਸਿਫਾਰਸ਼ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ।ਹਾਲਾਂਕਿ, ਬੇਸਿਕ ਪੇਪਟਾਇਡਸ (ਜੋ ਕਿ, pH 7 'ਤੇ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਚਾਰਜ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ), ਐਮੀਨੇਸ਼ਨ (ਐਨ-ਟਰਮੀਨਸ 'ਤੇ ਮੁਫਤ ਅਮੀਨੋ ਸਮੂਹ ਅਤੇ ਸੀ-ਟਰਮਿਨਸ 'ਤੇ ਐਮੀਨੇਸ਼ਨ) ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਚਾਰਜ ਨੂੰ ਵਧਾਉਣ ਦੀ ਸਿਫਾਰਸ਼ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ।

2. ਕ੍ਰਮ ਨੂੰ ਬਹੁਤ ਛੋਟਾ ਜਾਂ ਲੰਮਾ ਕਰੋ

ਕੁਝ ਕ੍ਰਮਾਂ ਵਿੱਚ ਹਾਈਡ੍ਰੋਫੋਬਿਕ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਦੀ ਇੱਕ ਵੱਡੀ ਗਿਣਤੀ ਹੁੰਦੀ ਹੈ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr ਅਤੇ Ala, ਆਦਿ। ਜਦੋਂ ਇਹ ਹਾਈਡ੍ਰੋਫੋਬਿਕ ਰਹਿੰਦ-ਖੂੰਹਦ 50% ਤੋਂ ਵੱਧ ਹੋ ਜਾਂਦੀ ਹੈ, ਤਾਂ ਇਹਨਾਂ ਨੂੰ ਘੁਲਣਾ ਆਸਾਨ ਨਹੀਂ ਹੁੰਦਾ।ਪੇਪਟਾਇਡ ਦੇ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਅਤੇ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਧਰੁਵਾਂ ਨੂੰ ਹੋਰ ਵਧਾਉਣ ਲਈ ਕ੍ਰਮ ਨੂੰ ਲੰਮਾ ਕਰਨਾ ਲਾਭਦਾਇਕ ਹੋ ਸਕਦਾ ਹੈ।ਦੂਜਾ ਵਿਕਲਪ ਹਾਈਡ੍ਰੋਫੋਬਿਕ ਰਹਿੰਦ-ਖੂੰਹਦ ਨੂੰ ਘਟਾ ਕੇ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਅਤੇ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਖੰਭਿਆਂ ਨੂੰ ਵਧਾਉਣ ਲਈ ਪੈਪਟਾਇਡ ਚੇਨ ਦੇ ਆਕਾਰ ਨੂੰ ਘਟਾਉਣਾ ਹੈ।ਪੇਪਟਾਇਡ ਚੇਨ ਦੇ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਅਤੇ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਪੱਖ ਜਿੰਨੇ ਮਜ਼ਬੂਤ ​​ਹੋਣਗੇ, ਪਾਣੀ ਨਾਲ ਪ੍ਰਤੀਕਿਰਿਆ ਕਰਨ ਦੀ ਸੰਭਾਵਨਾ ਓਨੀ ਹੀ ਜ਼ਿਆਦਾ ਹੋਵੇਗੀ।
3. ਪਾਣੀ ਵਿੱਚ ਘੁਲਣਸ਼ੀਲ ਰਹਿੰਦ-ਖੂੰਹਦ ਵਿੱਚ ਪਾਓ
ਕੁਝ ਪੇਪਟਾਇਡ ਚੇਨਾਂ ਲਈ, ਕੁਝ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਅਤੇ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਦਾ ਸੁਮੇਲ ਪਾਣੀ ਦੀ ਘੁਲਣਸ਼ੀਲਤਾ ਵਿੱਚ ਸੁਧਾਰ ਕਰ ਸਕਦਾ ਹੈ।ਸਾਡੀ ਕੰਪਨੀ ਐਸਿਡਿਕ ਪੇਪਟਾਇਡਸ ਦੇ ਐਨ-ਟਰਮਿਨਸ ਜਾਂ ਸੀ-ਟਰਮਿਨਸ ਨੂੰ ਗਲੂ-ਗਲੂ ਨਾਲ ਜੋੜਨ ਦੀ ਸਿਫ਼ਾਰਸ਼ ਕਰਦੀ ਹੈ।ਮੂਲ ਪੇਪਟਾਇਡ ਦਾ N ਜਾਂ C ਟਰਮਿਨਸ ਦਿੱਤਾ ਗਿਆ ਸੀ ਅਤੇ ਫਿਰ Lys-Lys.ਜੇਕਰ ਚਾਰਜ ਕੀਤੇ ਗਰੁੱਪ ਨੂੰ ਨਹੀਂ ਰੱਖਿਆ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ, ਤਾਂ Ser-Gly-Ser ਨੂੰ N ਜਾਂ C ਟਰਮੀਨਸ ਵਿੱਚ ਵੀ ਰੱਖਿਆ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ।ਹਾਲਾਂਕਿ, ਇਹ ਪਹੁੰਚ ਉਦੋਂ ਕੰਮ ਨਹੀਂ ਕਰਦੀ ਜਦੋਂ ਪੇਪਟਾਇਡ ਚੇਨ ਦੇ ਪਾਸਿਆਂ ਨੂੰ ਬਦਲਿਆ ਨਹੀਂ ਜਾ ਸਕਦਾ।