ਪੇਪਟਾਇਡ ਕਸਟਮ ਸਿੰਥੇਸਿਸ ਵਿੱਚ ਪੇਪਟਾਇਡ ਬਾਂਡ ਬਣਾਉਣ ਦਾ ਸਿਧਾਂਤ ਕਿਵੇਂ ਹੈ?

ਸਤ੍ਹਾ 'ਤੇ, ਪੇਪਟਾਇਡ ਬਾਂਡਾਂ ਦਾ ਗਠਨ, ਡਿਪੇਪਟਾਈਡ ਪੈਦਾ ਕਰਨਾ, ਇੱਕ ਸਧਾਰਨ ਰਸਾਇਣਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ ਹੈ।ਇਸਦਾ ਮਤਲਬ ਹੈ ਕਿ ਦੋ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਕੰਪੋਨੈਂਟ ਡੀਹਾਈਡ੍ਰੇਟ ਹੋਣ ਦੇ ਦੌਰਾਨ ਇੱਕ ਪੇਪਟਾਇਡ ਬਾਂਡ, ਇੱਕ ਐਮਾਈਡ ਬਾਂਡ ਦੁਆਰਾ ਜੁੜੇ ਹੋਏ ਹਨ।

ਪੇਪਟਾਇਡ ਬਾਂਡ ਦਾ ਗਠਨ ਹਲਕੇ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆ ਦੀਆਂ ਸਥਿਤੀਆਂ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਦੀ ਕਿਰਿਆਸ਼ੀਲਤਾ ਹੈ।(A) ਕਾਰਬੋਕਸਾਈਲ ਮੋਇਟੀ, ਦੂਸਰਾ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ (B) ਨਿਊਕਲੀਓਫਿਲਿਕ ਐਕਟੀਵੇਟਿਡ ਕਾਰਬੋਕਸਾਈਲ ਮੋਇਟੀ ਫਿਰ ਡਾਇਪੇਪਟਾਇਡ (AB) ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ।"ਜੇਕਰ ਕਾਰਬੌਕਸਿਲ ਕੰਪੋਨੈਂਟ (ਏ) ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਨਹੀਂ ਹੈ, ਤਾਂ ਪੇਪਟਾਇਡ ਬਾਂਡ ਦੇ ਗਠਨ ਨੂੰ ਨਿਯੰਤਰਿਤ ਨਹੀਂ ਕੀਤਾ ਜਾ ਸਕਦਾ।"ਉਪ-ਉਤਪਾਦਾਂ ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਰੇਖਿਕ ਅਤੇ ਚੱਕਰੀ ਪੈਪਟਾਇਡਸ ਨੂੰ ਟੀਚੇ ਦੇ ਮਿਸ਼ਰਣ AB ਨਾਲ ਮਿਲਾਇਆ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ।ਇਸਲਈ, ਪੇਪਟਾਇਡ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਦੇ ਦੌਰਾਨ ਸਾਰੇ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਸਮੂਹਾਂ ਨੂੰ ਪੈਪਟਾਇਡ ਬਾਂਡ ਬਣਾਉਣ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਨਾ ਹੋਣ ਵਾਲੇ ਇੱਕ ਅਸਥਾਈ ਤੌਰ 'ਤੇ ਉਲਟਾਉਣ ਯੋਗ ਤਰੀਕੇ ਨਾਲ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਕੀਤਾ ਜਾਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ।

ਇਸ ਲਈ, ਪੇਪਟਾਇਡ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ - ਹਰੇਕ ਪੇਪਟਾਇਡ ਬਾਂਡ ਦੇ ਗਠਨ - ਵਿੱਚ ਏਕੀਕਰਣ ਦੇ ਤਿੰਨ ਪੜਾਅ ਸ਼ਾਮਲ ਹੁੰਦੇ ਹਨ।

ਪਹਿਲਾ ਕਦਮ ਕੁਝ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਤਿਆਰ ਕਰਨਾ ਹੈ ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਨੂੰ ਸੁਰੱਖਿਆ ਦੀ ਲੋੜ ਹੈ, ਅਤੇ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਦੀ ਜ਼ਵਿਟਰਿਓਨਿਕ ਬਣਤਰ ਹੁਣ ਮੌਜੂਦ ਨਹੀਂ ਹੈ।

ਦੂਜਾ ਪੜਾਅ ਪੇਪਟਾਇਡ ਬਾਂਡ ਬਣਾਉਣ ਲਈ ਦੋ-ਪੜਾਅ ਵਾਲੀ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਐਨ-ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਦੇ ਕਾਰਬੋਕਸਾਈਲ ਸਮੂਹ ਨੂੰ ਪਹਿਲਾਂ ਕਿਰਿਆਸ਼ੀਲ ਇੰਟਰਮੀਡੀਏਟ ਵਿੱਚ ਸਰਗਰਮ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਫਿਰ ਪੇਪਟਾਇਡ ਬਾਂਡ ਬਣਦਾ ਹੈ।ਇਹ ਜੋੜੀ ਗਈ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆ ਜਾਂ ਤਾਂ ਇੱਕ-ਕਦਮ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆ ਜਾਂ ਦੋ ਕ੍ਰਮਵਾਰ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਦੇ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਹੋ ਸਕਦੀ ਹੈ।

ਤੀਜਾ ਕਦਮ ਹੈ ਚੋਣਵੇਂ ਹਟਾਉਣਾ ਜਾਂ ਸੁਰੱਖਿਆ ਅਧਾਰ ਨੂੰ ਪੂਰਾ ਕਰਨਾ।ਹਾਲਾਂਕਿ ਸਾਰੀਆਂ ਪੇਪਟਾਇਡ ਚੇਨਾਂ ਦੇ ਇਕੱਠੇ ਹੋਣ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਹੀ ਸਾਰੇ ਹਟਾਉਣੇ ਹੋ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਪੇਪਟਾਇਡ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਨੂੰ ਜਾਰੀ ਰੱਖਣ ਲਈ ਸੁਰੱਖਿਆ ਸਮੂਹਾਂ ਨੂੰ ਚੋਣਵੇਂ ਹਟਾਉਣ ਦੀ ਵੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ।

ਕਿਉਂਕਿ 10 ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ (Ser, Thr, Tyr, Asp, Glu, Lys, Arg, His, Sec ਅਤੇ Cys) ਵਿੱਚ ਸਾਈਡ ਚੇਨ ਫੰਕਸ਼ਨਲ ਗਰੁੱਪ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਨੂੰ ਚੋਣਤਮਕ ਸੁਰੱਖਿਆ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ, ਜਿਸ ਨਾਲ ਪੇਪਟਾਇਡ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਵਧੇਰੇ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।ਅਸਥਾਈ ਅਤੇ ਅਰਧ-ਸਥਾਈ ਸੁਰੱਖਿਆ ਅਧਾਰਾਂ ਨੂੰ ਚੋਣ ਲਈ ਵੱਖੋ ਵੱਖਰੀਆਂ ਜ਼ਰੂਰਤਾਂ ਦੇ ਕਾਰਨ ਵੱਖ ਕੀਤਾ ਜਾਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ।ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਜਾਂ ਕਾਰਬੌਕਸਿਲ ਫੰਕਸ਼ਨਲ ਗਰੁੱਪਾਂ ਦੀ ਅਸਥਾਈ ਸੁਰੱਖਿਆ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਣ ਲਈ ਅਗਲੇ ਪੜਾਅ ਵਿੱਚ ਅਸਥਾਈ ਸੁਰੱਖਿਆ ਸਮੂਹਾਂ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ।ਅਰਧ-ਸਥਾਈ ਸੁਰੱਖਿਆ ਸਮੂਹਾਂ ਨੂੰ ਪਹਿਲਾਂ ਤੋਂ ਬਣੇ ਪੇਪਟਾਇਡ ਬਾਂਡਾਂ ਜਾਂ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਸਾਈਡ ਚੇਨਾਂ ਵਿੱਚ ਦਖਲ ਦਿੱਤੇ ਬਿਨਾਂ ਹਟਾ ਦਿੱਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਕਈ ਵਾਰ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਦੌਰਾਨ।

"ਆਦਰਸ਼ ਤੌਰ 'ਤੇ, ਕਾਰਬੌਕਸਿਲ ਕੰਪੋਨੈਂਟ ਦੀ ਸਰਗਰਮੀ ਅਤੇ ਬਾਅਦ ਵਿੱਚ ਪੇਪਟਾਇਡ ਬਾਂਡਾਂ (ਕਪਲਿੰਗ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆਵਾਂ) ਦਾ ਗਠਨ ਤੇਜ਼ ਹੋਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ, ਰੇਸਮਿਕ ਜਾਂ ਉਪ-ਉਤਪਾਦ ਦੇ ਗਠਨ ਤੋਂ ਬਿਨਾਂ, ਅਤੇ ਉੱਚ ਉਪਜ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਨ ਲਈ ਮੋਲਰ ਰੀਐਕਟੈਂਟਸ ਨੂੰ ਲਾਗੂ ਕੀਤਾ ਜਾਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ."ਬਦਕਿਸਮਤੀ ਨਾਲ, ਕੋਈ ਵੀ ਰਸਾਇਣਕ ਜੋੜਨ ਦਾ ਤਰੀਕਾ ਇਹਨਾਂ ਲੋੜਾਂ ਨੂੰ ਪੂਰਾ ਨਹੀਂ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਅਤੇ ਕੁਝ ਵਿਹਾਰਕ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਢੁਕਵੇਂ ਹਨ।

ਪੇਪਟਾਇਡ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਦੇ ਦੌਰਾਨ, ਵੱਖ-ਵੱਖ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਸਮੂਹ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਮੈਨੂਅਲ ਸੈਂਟਰ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਗਲਾਈਸੀਨ ਇੱਕਮਾਤਰ ਅਪਵਾਦ ਹੈ, ਅਤੇ ਰੋਟੇਸ਼ਨ ਦਾ ਇੱਕ ਸੰਭਾਵੀ ਜੋਖਮ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।

ਪੇਪਟਾਇਡ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਚੱਕਰ ਦਾ ਅੰਤਮ ਪੜਾਅ ਸਾਰੇ ਸੁਰੱਖਿਆ ਸਮੂਹਾਂ ਨੂੰ ਹਟਾਉਣਾ ਹੈ।ਡਾਈਪੇਪਟਾਇਡ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਸੁਰੱਖਿਆ ਨੂੰ ਪੂਰੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਹਟਾਉਣ ਦੀ ਜ਼ਰੂਰਤ ਦੇ ਨਾਲ-ਨਾਲ ਪੈਪਟਾਇਡ ਚੇਨ ਐਕਸਟੈਂਸ਼ਨ ਲਈ ਸੁਰੱਖਿਆ ਸਮੂਹਾਂ ਨੂੰ ਚੋਣਵੇਂ ਤੌਰ 'ਤੇ ਹਟਾਉਣਾ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੈ।ਸਿੰਥੈਟਿਕ ਰਣਨੀਤੀਆਂ ਨੂੰ ਧਿਆਨ ਨਾਲ ਯੋਜਨਾਬੱਧ ਕੀਤਾ ਜਾਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ.ਰਣਨੀਤਕ ਚੋਣ 'ਤੇ ਨਿਰਭਰ ਕਰਦੇ ਹੋਏ, N α-ਅਮੀਨੋ ਜਾਂ ਕਾਰਬੌਕਸਿਲ ਸੁਰੱਖਿਆ ਸਮੂਹਾਂ ਨੂੰ ਚੋਣਵੇਂ ਤੌਰ 'ਤੇ ਹਟਾ ਸਕਦਾ ਹੈ।ਸ਼ਬਦ "ਰਣਨੀਤੀ" ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਦੇ ਸੰਘਣਾਪਣ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਦੇ ਕ੍ਰਮ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ।ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ, ਹੌਲੀ-ਹੌਲੀ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਟੁਕੜੇ ਸੰਘਣਾਪਣ ਵਿੱਚ ਅੰਤਰ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।ਪੇਪਟਾਇਡ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ (ਜਿਸ ਨੂੰ "ਰਵਾਇਤੀ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ" ਵੀ ਕਿਹਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ) ਘੋਲ ਵਿੱਚ ਵਾਪਰਦਾ ਹੈ।ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਮਾਮਲਿਆਂ ਵਿੱਚ, ਪੈਪਟਾਇਡ ਚੇਨ ਦੇ ਹੌਲੀ-ਹੌਲੀ ਲੰਬਾਈ ਨੂੰ ਛੋਟੇ ਟੁਕੜਿਆਂ ਨੂੰ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ ਪੇਪਟਾਇਡ ਚੇਨ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ ਹੀ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਕੀਤਾ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ।ਲੰਬੇ ਪੈਪਟਾਇਡਸ ਨੂੰ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ, ਟੀਚੇ ਦੇ ਅਣੂਆਂ ਨੂੰ ਢੁਕਵੇਂ ਟੁਕੜਿਆਂ ਵਿੱਚ ਵੰਡਿਆ ਜਾਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਇਹ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕੀਤਾ ਜਾਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ ਕਿ ਉਹ C ਟਰਮਿਨਸ 'ਤੇ ਅੰਤਰ ਦੀ ਡਿਗਰੀ ਨੂੰ ਘੱਟ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ।ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਟੁਕੜਿਆਂ ਦੇ ਹੌਲੀ-ਹੌਲੀ ਇਕੱਠੇ ਹੋਣ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, ਨਿਸ਼ਾਨਾ ਮਿਸ਼ਰਣ ਜੋੜਿਆ ਜਾਵੇਗਾ।ਪੇਪਟਾਇਡ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਦੀ ਰਣਨੀਤੀ ਵਿੱਚ ਸਭ ਤੋਂ ਵਧੀਆ ਅਤੇ ਸਭ ਤੋਂ ਢੁਕਵੇਂ ਸੁਰੱਖਿਆ ਟੁਕੜੇ ਦੀ ਚੋਣ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ, ਅਤੇ ਪੇਪਟਾਇਡ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਦੀ ਰਣਨੀਤੀ ਵਿੱਚ ਸੁਰੱਖਿਆ ਆਧਾਰਾਂ ਦੇ ਸਭ ਤੋਂ ਢੁਕਵੇਂ ਸੁਮੇਲ ਦੀ ਚੋਣ ਅਤੇ ਟੁਕੜੇ ਦੇ ਸੰਜੋਗ ਦੇ ਸਭ ਤੋਂ ਵਧੀਆ ਢੰਗ ਦੀ ਚੋਣ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ।